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標題: 大數(shù)據(jù)和云計算幫助實現(xiàn)精準醫(yī)療 [打印本頁]

作者: 寂靜天花板 時間: 2015-9-11 18:46
標題: 大數(shù)據(jù)和云計算幫助實現(xiàn)精準醫(yī)療
今年3月我國成立了精準醫(yī)療戰(zhàn)略專家組，國家衛(wèi)計委和科技部多次召開會議，論證啟動精準醫(yī)療計劃。一時間全國各地與精準醫(yī)療相關(guān)的機構(gòu)和協(xié)會如雨后春筍一般出現(xiàn)，例如北京協(xié)和醫(yī)院、四川大學(xué)華西醫(yī)院等三甲醫(yī)院籌建的精準醫(yī)療研究中心。各地與精準醫(yī)療相關(guān)的論壇和項目也如火如荼的開展起來，例如在杭州舉辦的第四屆Bio4P國際高峰精準醫(yī)療與智慧健康論壇，華西醫(yī)院開展的總數(shù)達一百萬人的全基因組測序，據(jù)悉中科院北京基因組研究所以及幾家大機構(gòu)已經(jīng)在啟動類似的百萬人全基因組測序計劃。
　　7月29日在央視《朝聞天下》的一個欄目里面，新聞頻道針對“聚焦精準醫(yī)療”主題對精準醫(yī)療做了一個老百姓通俗易懂的介紹。簡單來說，精準醫(yī)療就是利用現(xiàn)代化的醫(yī)學(xué)手段為患者制定個性化的預(yù)防和治療方案。節(jié)目全面回應(yīng)了這一在2015上半年引爆科學(xué)界和醫(yī)藥圈的概念。然而故事還沒有結(jié)束，媒體報道里面每天充斥著各種醫(yī)療概念和技術(shù)：分子學(xué)診斷、基因檢測、靶向藥物、個性化用藥。。。但是，這些都是“醫(yī)療”，“精準”去了哪里呢?實現(xiàn)“精準”的大數(shù)據(jù)和云計算應(yīng)該在哪里體現(xiàn)呢?

　　精準醫(yī)療的核心在于精準，而不是醫(yī)療

　　醫(yī)療本身有其發(fā)展的規(guī)律和方式。這里精準的實現(xiàn)，需要醫(yī)療大數(shù)據(jù)的實現(xiàn)，而實現(xiàn)醫(yī)療大數(shù)據(jù)的前提，需要云計算的助力。然而我們必須清楚的一點，云計算無法解決醫(yī)療問題，只能是快速準確發(fā)現(xiàn)問題的存在。云解決方案既無法解決醫(yī)療問題，也無法發(fā)現(xiàn)醫(yī)療背后的大數(shù)據(jù)問題，能夠發(fā)現(xiàn)問題的，在于生物信息學(xué)。是否生物信息學(xué)需要云計算才能解決臨床問題，這里需要打上一個很大的問號。

　　云解決方案能夠助力生物信息提供解決方案，但不是一個必需品。好比我們需要解決的是吃飽問題的時候，花太多的時間在研究用綠色還是紅色的碗子盛飯，用深盤子還是淺盤子來盛菜，這些都是無法解決痛點的無用功。現(xiàn)在中國云計算的現(xiàn)狀就是這樣，一方面云計算在各個行業(yè)還沒有做到足夠深的整合和足夠廣的覆蓋度，另一方面在傳統(tǒng)醫(yī)療領(lǐng)域還沒有達到足夠完善的信息化。

　　信息化不等于大數(shù)據(jù)英特爾公司生命科學(xué)全球總經(jīng)理Ketan Paranjape曾經(jīng)在接受記者采訪時提到過大而復(fù)雜的基因數(shù)據(jù)在采集、傳輸、存儲、分析等方面，帶來了對計算的要求、對存儲的要求、對網(wǎng)絡(luò)的要求，包括高性能計算。從大數(shù)據(jù)的采集層面來看，這里需要國家的投入。在中國基因行業(yè)的發(fā)展中，這方面投入的最多的當之無愧是華大基因了。其中最值得耐人尋味的是，數(shù)據(jù)采集本應(yīng)該是國家投入的基礎(chǔ)科學(xué)研究，在中國卻成為了讓企業(yè)來承擔(dān)的一項工程。毫無疑問，通過企業(yè)燒錢來完成數(shù)據(jù)采集這一步，這種模式是無法復(fù)制和模仿的。用華大基因首席科學(xué)家李英睿先生的話來說：“華大基因一方面是做基礎(chǔ)的科學(xué)研究，另一方面是把基礎(chǔ)科學(xué)的研究成果轉(zhuǎn)化為公眾可以使用的真實產(chǎn)品。我們主要通過整合各種平臺和技術(shù)手段給公眾提供相應(yīng)的臨床服務(wù)。”換一句話來說就是，華大基因從上游到下游，從B端到C端，從產(chǎn)學(xué)研閉環(huán)來說，已經(jīng)全部能夠通吃通做。

　　既然華大基因能夠通過通吃來完成數(shù)據(jù)采集，我們不得不提出一個問題：大數(shù)據(jù)的本質(zhì)是什么?大數(shù)據(jù)的形成一定不是由壟斷的巨頭來完成。大數(shù)據(jù)的4V特點是大量 (Volume)、高速 (Velocity)、多樣 (Variety)、價值 (Value)。這里的數(shù)據(jù)有一個產(chǎn)生的過程，產(chǎn)生的過程能夠進行采集。很多的互聯(lián)網(wǎng)巨頭通過控制數(shù)據(jù)的入口來達到大數(shù)據(jù)的采集，比如谷歌和百度。在產(chǎn)業(yè)界，各企業(yè)對數(shù)據(jù)入口的爭奪一直都沒有停止過。入口能夠隨著科技的發(fā)展和人們生活方式的改變而發(fā)生遷移，比如從微博到微信，從網(wǎng)頁端到移動端。對入口的控制通常可以通過控制設(shè)備實現(xiàn)，也可以通過平臺實現(xiàn)。比如蘋果手機和小米手機就是通過設(shè)備來實現(xiàn)控制數(shù)據(jù)的入口，微信平臺就是通過控制平臺實現(xiàn)了數(shù)據(jù)流量的入口控制。

　　設(shè)備和平臺在基因行業(yè)，最終能夠?qū)崿F(xiàn)入口為王的兩個方式：設(shè)備和平臺。采集數(shù)據(jù)需要設(shè)備，分析數(shù)據(jù)需要平臺。這里的設(shè)備只有實現(xiàn)互聯(lián)網(wǎng)化的智能設(shè)備，才能勝任大數(shù)據(jù)時代通過控制設(shè)備達到控制入口的目的。比如Illumina的測序儀，如果只是一臺生產(chǎn)基因數(shù)據(jù)的儀器，Illumina是無法成為未來基因行業(yè)巨頭的。只有讓每一臺設(shè)備接入Illumina的在線追蹤系統(tǒng)，Illumina的系統(tǒng)能夠追蹤每一個上機的樣本信息，一旦設(shè)備接入互聯(lián)網(wǎng)，所有的樣本信息和數(shù)據(jù)信息能夠自動同步到設(shè)備控制的數(shù)據(jù)中心進行采集。每一臺設(shè)備不僅能夠傳輸設(shè)備的狀態(tài)監(jiān)測數(shù)據(jù)、樣本信息，還能夠傳輸每臺設(shè)備的使用情況和地理位置。這些數(shù)據(jù)的采集便是通過設(shè)備來控制數(shù)據(jù)的入口。另一個數(shù)據(jù)的入口便是數(shù)據(jù)分析平臺，這里通過對數(shù)據(jù)的處理和分析實現(xiàn)對入口的控制。儀器設(shè)備廠商能否也做這一塊呢，答案是可以的，不過代價非常的高。其中一個關(guān)鍵的原因在于基因數(shù)據(jù)分析的個性化和碎片化。要解決這個原因的答案就是平臺，這里的平臺不是云平臺。很多的人分不清基因大數(shù)據(jù)平臺和基因大數(shù)據(jù)云平臺這兩者的區(qū)別，其實能夠類比的例子就是阿里巴巴平臺和阿里巴巴云平臺。

　　云平臺只是實現(xiàn)平臺的一個技術(shù)載體，真正的核心不是在于云計算本身，而是在于對平臺的運營和模式的實現(xiàn)。所以很多人對于奇云諾德的理解就是基因大數(shù)據(jù)云平臺，而忘記這里準確的定義是基因大數(shù)據(jù)平臺，云平臺只是實現(xiàn)在線的一個技術(shù)模塊。如果說滴滴打車的核心在于托管滴滴打車平臺的云平臺，顯然這是很錯誤的理解。

　　只有明白了這一點，我們再來看云計算對于精準醫(yī)療的助力，只能是實現(xiàn)精準的計算載體。從云計算對于數(shù)據(jù)采集的入口來看，這里更大的貢獻其實是解決了數(shù)據(jù)的碎片化。通過互聯(lián)網(wǎng)的在線平臺把碎片化的資源整合起來實現(xiàn)大數(shù)據(jù)采集。

　　從這樣的趨勢來看，云計算的發(fā)展是去中心化一個過程，最終像華大基因這樣的巨頭控制的數(shù)據(jù)采集方式會被云計算的推廣所弱化。以云計算為核心的基因大數(shù)據(jù)平臺會迅速的發(fā)展起來。這是實現(xiàn)精準醫(yī)療的第一個階段，數(shù)據(jù)的云端化。云計算助力精準醫(yī)療的第二個階段，實現(xiàn)數(shù)據(jù)的安全性管理。

　　沒有一家企業(yè)能夠保證數(shù)據(jù)的安全性。商業(yè)界的規(guī)律永遠是用戶為王。用戶對于數(shù)據(jù)安全和個人隱私的意識是與生具有的人性，用戶的對數(shù)據(jù)安全的敏感度取決于維護的代價和門檻有多高。基因數(shù)據(jù)的安全性從數(shù)據(jù)產(chǎn)生開始就存在，具體在哪個環(huán)節(jié)得到用戶的重視，取決于基因產(chǎn)業(yè)的成熟程度。云計算在數(shù)據(jù)安全性問題解決方案上面已經(jīng)相對成熟，具體到基因數(shù)據(jù)是否適用，我相信這是一個技術(shù)問題而不是一個道德問題。但是有一點能夠肯定的是，基因數(shù)據(jù)的安全性維護必定托管于第三方屬性很強的平臺，而不會是華大基因這樣的數(shù)據(jù)生產(chǎn)供應(yīng)商。因為要用戶接受裁判和運動員都是同一個人是很難理解的，除非這個行業(yè)非常的小眾和封閉。

作者: leftwall 時間: 2015-9-11 20:14
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